На дарогах у he Brain Train робіцца суцэльнае беззаконне і хаос. Аўтамабілі перакрываюць чыгуначныя пуці і вы павінны расчысціць іх, даючы свабоду для праходжання цягніка. Механізм расчысткі вызначаецца правілам - тры ў шэраг. Вы павінны дадаць да ўжо стаялага транспарта яшчэ машынкі, каб у шэрагу апынулася тры аднолькавых. Яны знікнуць, а састаў рушыць далей.